分成两种情况分析。

一、公司没有工资支出，即工资支出为0

这种情况存在于很多初创公司中。如果企业没有员工（包括法人），那么相应的也就没有工资支出，这时候零申报个税时没有问题的。还有就是企业出现正常的停工（比如东北地区冬季户外无法施工）导致员工无法发工资的，企业也可以根据实际情况零申报工资。

但如果企业连续12个月（或者更久） 零申报工资，可能会面临税务机关的稽查。比如企业法人长期申报0元工资，会被税务局怀疑是否以报销个人费用的方式偷逃个税。

二、公司有工资支出，但不纳税（即个人所得税应纳税所得额=0）。

自从个税起征点调到5000后，有些公司就利用起征点调节工资数，比如应纳税所得额为5500，但因为起征点的原因，申报个税时以5000申报。小编在这里提醒大家：工资发多少就申报多少，不要人为的调节，否则长期财务报表数据与社保申报数据不一致，会引起税局机关的注意，从而成为重点监管对象。

因此，为了长远发展，企业一定要合法合理发放工资，正常缴纳社保，加之现在专项附加扣除的存在，无论是法人还是员工，个税负担都大大降低，没有必要因为长期零申报而引发企业的风险。